Die Reproduktionstoxizität weist viele einzigartige und herausfordernde Unterschiede zwischen der Toxizität und anderen Systemen auf. Während andere Formen der Umwelttoxizität typischerweise die Entwicklung einer Krankheit bei einer exponierten Person beinhalten, da die Reproduktion die Interaktion zwischen zwei Personen erfordert, wird die Reproduktionstoxizität innerhalb einer reproduktiven Einheit oder eines Paares ausgedrückt. Dieser einzigartige, paarabhängige Aspekt, obwohl offensichtlich, unterscheidet die Reproduktionstoxikologie. Beispielsweise ist es möglich, dass sich die Exposition gegenüber einem Giftstoff durch ein Mitglied eines reproduktiven Paares (z. B. den Mann) in einem nachteiligen Fortpflanzungsergebnis bei dem anderen Mitglied des Paares manifestiert (z. B. erhöhte Häufigkeit spontaner Fehlgeburten). Jeder Versuch, sich mit umweltbedingten Ursachen der Reproduktionstoxizität auseinanderzusetzen, muss den paarspezifischen Aspekt berücksichtigen.
Es gibt noch andere einzigartige Aspekte, die die Herausforderungen der Reproduktionstoxikologie widerspiegeln. Im Gegensatz zur Nieren-, Herz- oder Lungenfunktion tritt die Fortpflanzungsfunktion intermittierend auf. Dies bedeutet, dass berufliche Expositionen die Fortpflanzung beeinträchtigen können, aber in Zeiten, in denen keine Fruchtbarkeit erwünscht ist, unbemerkt bleiben. Diese intermittierende Eigenschaft kann die Identifizierung eines reproduktionstoxischen Stoffes beim Menschen erschweren. Ein weiteres einzigartiges Merkmal der Fortpflanzung, das direkt aus der obigen Überlegung folgt, besteht darin, dass eine vollständige Beurteilung der funktionellen Integrität des Fortpflanzungssystems erfordert, dass das Paar eine Schwangerschaft versucht.