消化系統對身體的工作效率和工作能力有相當大的影響，消化系統的急慢性疾病是導致曠工和殘疾的最常見原因。 在這種情況下，可以通過以下任一方式要求職業醫師根據特定職業的特定需求提供有關衛生和營養要求的建議：評估職業固有因素可能對以下任一方面產生的影響造成消化系統病態，或加重其他可能預先存在或獨立於職業的情況； 或表達關於一般或特定適合該職業的意見。
許多對消化系統有害的因素可能與職業有關； 很多因素經常協同作用，而且它們的作用可能因個人傾向而得到促進。 以下是最重要的職業因素：工業毒物； 物理代理； 和職業壓力，如緊張、疲勞、不正常的姿勢、工作節奏的頻繁變化、輪班工作、夜班和不適當的飲食習慣（進餐的數量、質量和時間）。
化學危害
消化系統可能是有毒物質進入體內的門戶，儘管它在這裡的作用通常遠不如呼吸系統重要，呼吸系統的吸收表面積為 80-100 m2 而消化系統的相應數字不超過 20 m2. 此外，通過吸入進入人體的蒸氣和氣體會到達血流，從而到達大腦，而無需任何中間防禦； 然而，攝入的毒物在到達血管床之前會被過濾並在一定程度上被肝臟代謝。 然而，有機物和功能性損害可能發生在進入和排出體內的過程中，或者由於在某些器官中的積累而發生。 身體遭受的這種損害可能是有毒物質本身、其代謝物或身體某些必需物質耗盡的結果。 特質和過敏機制也可能發揮作用。 攝入腐蝕性物質仍然是相當常見的意外事件。 在丹麥的一項回顧性研究中，食管燒傷的年發病率為 1/100,000，住院率為 0.8/100,000 成人人年。 許多家用化學品都具有腐蝕性。
毒性機制非常複雜，並且可能因物質而異。 工業中使用的某些元素和化合物會對消化系統造成局部損害，例如影響口腔和鄰近區域、胃、腸、肝或胰腺。
溶劑對富含脂質的組織具有特殊的親和力。 毒性作用通常很複雜，涉及不同的機制。 在四氯化碳的情況下，肝損傷被認為主要是由於有毒代謝物。 在二硫化碳的情況下，胃腸道受累歸因於該物質對壁間神經叢的特定神經營養作用，而肝損傷似乎更多是由於溶劑的細胞毒作用，這會導致脂蛋白代謝發生變化。
肝損傷是外源性毒物病理學的重要組成部分，因為肝臟是代謝毒物的主要器官，並在解毒過程中與腎臟一起作用。 膽汁直接或結合後從肝臟接收各種可在腸肝循環中被重吸收的物質（例如，鎘、鈷、錳）。 肝細胞參與氧化（如醇類、酚類、甲苯）、還原（如硝基化合物）、甲基化（如硒酸）、與硫酸或葡萄醣醛酸（如苯）結合、乙酰化（如芳香胺） . 例如，Kupffer 細胞也可能通過吞噬重金屬進行干預。
嚴重的胃腸道綜合徵，例如由磷、汞或砷引起的那些，表現為嘔吐、絞痛、血性粘液和糞便，並可能伴有肝損傷（肝腫大、黃疸）。 現在這種情況比較少見，已經被緩慢甚至潛伏發展的職業中毒所取代； 因此，肝損傷通常也很隱蔽。
傳染性肝炎值得特別提及； 它可能與許多職業因素有關（肝毒性藥物、高溫或高溫工作、寒冷或寒冷的工作、劇烈的體力活動等），可能有不利的病程（遷延或持續的慢性肝炎）並可能容易導致肝硬化. 它經常與黃疸一起發生，因此造成診斷困難； 此外，它還帶來了預後和估計恢復程度的困難，因此難以恢復工作。
儘管胃腸道內棲息著豐富的微生物群落，這些微生物群落對人體健康具有重要的生理功能，但職業暴露可能會引起職業感染。 例如，屠宰場工人可能有感染 幽門螺桿菌 感染。 這種感染通常是無症狀的。 其他重要的感染包括 沙門氏菌 和 志賀氏菌 物種，也必須加以控制以維護產品安全，例如在食品工業和餐飲服務中。
吸煙和飲酒是工業化國家食管癌的主要風險，職業病因學的重要性較低。 然而，屠夫及其配偶患結直腸癌的風險似乎更高。
物理因素
各種物理因素可能導致消化系統綜合症； 這些包括直接或間接致殘創傷、電離輻射、振動、快速加速、噪音、極高和極低溫度或猛烈和反复的氣候變化。 燒傷，尤其是大面積燒傷，可能會導致胃潰瘍和肝損傷，並可能伴有黃疸。 不正常的姿勢或動作可能會導致消化系統紊亂，特別是如果存在食管旁疝、內臟下垂或 膈肌鬆弛； 此外，當消化系統疾病伴有自主神經系統或神經心理問題時，可能會出現胃灼熱等消化外反應。 這種類型的問題在現代工作環境中很常見，並且可能本身就是腸胃功能障礙的原因。
職業壓力
身體疲勞也可能擾亂消化功能，繁重的工作可能導致分泌運動障礙和營養不良變化，尤其是在胃部。 患有胃病的人，尤其是那些接受過手術的人，他們能做的繁重工作量有限，這僅僅是因為繁重的工作需要更高水平的營養。
輪班工作可能會導致飲食習慣發生重大變化，從而導致功能性胃腸問題。 輪班工作可能與血液中膽固醇和甘油三酯水平升高以及血清中γ-谷氨酰轉移酶活性升高有關。
神經性胃消化不良（或胃神經官能症）似乎根本沒有胃或胃外原因，也不是任何體液或代謝紊亂的結果； 因此，它被認為是由於自主神經系統的原始紊亂，有時與過度的精神消耗或情緒或心理壓力有關。 胃病症通常表現為神經性分泌過多或運動過度或失張力神經症（後者通常與胃下垂有關）。 上腹痛、反流和吞氣症也可能歸入神經性胃消化不良的範疇。 消除工作環境中有害的心理因素可能導致症狀緩解。
一些觀察結果表明，承擔責任的人患消化性潰瘍的頻率增加，例如主管和行政人員、從事非常繁重工作的工人、工業新人、移民工人、海員和承受嚴重社會經濟壓力的工人。 然而，許多患有相同疾病的人過著正常的職業生活，而且缺乏統計證據。 除了工作條件外，飲酒、吸煙和飲食習慣以及家庭和社會生活都對消化不良的發生和延長有影響，而且很難確定每一個因素在該病的病因學中所起的作用。
消化系統疾病也被歸因於輪班工作，這是由於工作場所進餐時間的頻繁變化和不良飲食造成的。 這些因素會加重先前存在的消化問題並引發神經性消化不良。 因此，工人只有在體檢後才能安排輪班工作。
醫療監督
可以看出，職業健康從業者在消化系統投訴的診斷和估計方面面臨著許多困難（由於 尤其是有害的非職業因素所起的作用），並且他或她在預防職業性障礙方面的責任是相當大的。
早期診斷極其重要，意味著定期進行體檢和監督工作環境，尤其是在風險級別很高的情況下。
對公眾，尤其是對工人進行健康教育是一項有價值的預防措施，可能會產生實質性的效果。 應注意營養需求、食物的選擇和準備、進餐的時間和份量、適當咀嚼和適度食用油膩食物、酒精和冷飲，或從飲食中完全消除這些物質。